cas-témoins
Résumé de l'arrière-plan
(S. mutans de
) de Streptococcus mutans est le primaire agent étiologique de la carie dentaire. Sortase est un transpeptidase qui ancre plusieurs protéines de surface à la paroi cellulaire des S. mutans et a été montré à jouer un rôle majeur dans cariogène. Le but de cette étude était d'explorer les polymorphismes génétiques du gène sortase (srta de
) et les facteurs sociaux-comportementaux associés à la carie dentaire chez les enfants avec S. mutans
.
Méthodes
Dans ce étude cas-témoins, les souches de 121 S. mutans ont été choisi séparément enfants sans carie et de haute gravité des caries des enfants pour le séquençage du gène de la srta. Les données sociales et comportementales ont été recueillies par questionnaires auto-administrés. L'ADN génomique a été extrait des souches de S. mutans et amplifié par PCR pour obtenir le gène de srta. Les produits purifiés PCR ont été séquencés et analysés pour des mutations avec le logiciel Reporter ABI Variant. La distribution des mutations faux-sens et la moyenne des facteurs socio-comportementaux ont été comparés entre les groupes. Un modèle de régression logistique multiple a été utilisée pour contrôler les facteurs de confusion
. Résultats
Les fréquences de mutation au locus 168 (P = 0,023
) et 470 (P = 0,032
) étaient significativement différents entre les groupes . Le meilleur modèle a montré que plus l'âge, les hautes fréquences de consommation solide en sucre, l'allaitement prolongé, une forte proportion de la plaque visible, et S. mutans
avec un T au lieu 168 du gène de la srta ont été associés à caries haute gravité chez les enfants (P
& lt; 0,05). Enfants portant un G au locus 168 de S. mutans
avait une diminution du risque de carie de haute gravité (OR = 0,32, IC à 95% = 0,12 au 0,86) par rapport à ceux qui portent les conclusions d'un T.
la présente étude suggère que la mutation faux-sens du gène du locus srta 168 peut corréler avec la carie sensibilité chez les enfants avec S. mutans
. En outre, l'âge, la durée de l'allaitement maternel, la consommation de sucre solide, et une mauvaise hygiène buccale a contribué à cette maladie complexe.
Mots-clés
Caries Gene polymorphismes srta
Streptococcus mutans
Li Xia Yu Ye Tao contribué également à ce travail.
Contexte
la carie dentaire est la destruction localisée des tissus durs dentaires par les sous-produits acides de la fermentation bactérienne des glucides alimentaires [1]. micro-organismes oraux, les habitudes alimentaires et la sensibilité des hôtes interagissent dans l'initiation et le développement de la carie dentaire [2]. En général, les variables socio-démographiques, les caractéristiques de développement, l'éducation générale, santé bucco-dentaire liés comportement, hygiène bucco-dentaire et les bactéries sont connus des facteurs de risque pour le développement de la carie dentaire chez les enfants [3]. Il est une maladie mondiale commune affectant la santé et le bien-être [2,4,5], en particulier en Chine pour enfants. L'Enquête sur la santé bucco-dentaire Troisième nationale en Chine a montré que la prévalence de la carie de la petite dans les 5 ans le groupe d'âge était aussi élevé que 66% et que le nombre moyen de dents cariées, manquantes et obturées (CAOD) était de 3,5 [6] .
Streptococcus mutans
(S. mutans
) est l'agent étiologique primaire de la carie dentaire [7]. Bien que l'association entre S. mutans
et la carie dentaire semble convaincante, certains enfants avec S. mutans
ne manifestent pas la maladie, ce qui suggère que S. mutans
peut varier dans sa capacité à initier des caries. Une caractéristique importante de S. mutans
dans le développement des caries dentaires est son aptitude à adhérer à la surface de la dent. Pac est l'une des protéines de surface cellulaire ancrés paroi identifiés dans S. mutans
, et elle est responsable de la médiation de l'adhésion de S. mutans
à la surface des dents [8]. Sortase A (srta), codée par le srta gène
, a été montré comme une transpeptidase membranaire localisée qui lie de manière covalente la protéine Pac avec un signal de tri sur la paroi de la cellule et possède des fonctions adhérentes importantes qui ont été associés à cariogène [ ,,,0],9,10].
S. mutans avec un gène muté srta
a été montré pour aboutir à une réduction marquée du potentiel d'adhérence de S. mutans
et la fréquence des caries dentaires [11]. Étant donné qu'une fonction importante de srta
est l'adhésion de S. mutans
à la surface de la dent, nous avons émis l'hypothèse que le gène de srta de S. mutans
pourrait posséder des polymorphismes génétiques liées à différentes conditions de caries.
Compte tenu de l'étiologie complexe de la carie dentaire, la virulence et la colonisation de S. mutans
peuvent être modulés par des facteurs comportementaux, sociaux et environnementaux [12,13]. Dans cette étude, nous avons cherché à explorer les polymorphismes génétiques du gène de la srta et les facteurs sociaux-comportementaux associés à la carie dentaire chez les enfants avec S. mutans
.
Méthodes
Calcul de la taille de l'échantillon de l'étude
Une conception de groupe de cas-témoins a été appliqué dans cette étude. Selon la conception de l'étude, les formules utilisées pour calculer le séquençage des capacités d'échantillons sont présentés ci-dessous [14] Formule 1 de:. \\ (N = \\ frac {N ^ {\\ hbox { '}}} {4} {\\ gauche (1+ \\ sqrt {1+ \\ frac {4} {N ^ {\\ hbox { '}} \\ delta}} \\ right)} ^ 2 \\)
Formule 2: \\ ( {N}^{\\hbox{'}}=\\frac{{\\left[{Z}_{\\alpha}\\sqrt{\\left(1+1/C\
ight){\\pi}_c\\left(1-{\\pi}_c\
ight)}+{Z}_{\\beta}\\sqrt{\\pi_2\\left(1-{\\pi}_2\
ight)+{\\pi}_1\\left(1-{\\pi}_1\
ight)/C}\
ight]}^2}{{\\left({\\pi}_2-{\\pi}_1\
ight)}^2} \\)
Formule 3: \\ ({\\ pi} _c = \\ frac {\\ pi_2 + {\\ pi} _1} {2} \\)
Formule 4: δ
= | π
1 - π
2 |
Le nombre d'enfants a été réglée pour être égale dans les groupes de cas et de contrôle. Ainsi, la valeur de C
était de 1,0. La valeur de α a été fixée à 0,05, et la valeur de β a été fixé à 0,15. Les valeurs de π
1 et π
2 fait référence aux taux de mutation faux-sens prédites de srta
dans les groupes de contrôle et de cas dans la présente étude, respectivement. Sur la base des taux de chaque locus de mutation faux-sens dans la carie libres et des groupes caries actifs de nos travaux précédents [15], la plus grande taille de l'échantillon était nécessaire lorsque π
1 = 0,6 et π
< sub> 2 = 0,4, respectivement. On a donc calculé que la taille de l'échantillon devrait être de 121 enfants pour chaque groupe. Tous les tests statistiques étaient bilatéraux.
Parce que cette étude vise principalement à explorer les liens entre les mutations faux-sens de srta
et la gravité de la carie chez les enfants avec S. mutans
, seuls les enfants qui portaient S. mutans
ont été analysés. Pour satisfaire à la taille de l'échantillon, nous avons calculé le nombre d'enfants qui ont été nécessaires pour l'enquête épidémiologique. Le taux de caries (68%) et les non-caries (32%) chez les jeunes enfants [16], ainsi que le taux de S. mutans de prévalence prévalence
dans le groupe sans carie (37,5%) et le caries- groupe actif (75%), ont été considérés [17]. Le nombre minimum d'enfants requis pour enquêter a donc été calculée à 1009. Enquête sur le terrain
Une enquête épidémiologique a été menée dans le district de Huadu de Guangzhou dans le sud de la Chine d'Octobre 2012 Juin 2013. Le protocole d'étude a été approuvé par le Comité d'éthique de Guanghua School of Stomatologie, Université Sun Yat-sen (ERC- [2012] -13). Le district de Huadu est un nouveau quartier urbain qui se compose de quatre rues et six villes. Il y avait 114 écoles maternelles dans ce district. Une technique d'échantillonnage en grappes aléatoire a été utilisé pour sélectionner 19 écoles en fonction du nombre d'enfants que nous avions besoin de recruter. Seuls les enfants qui étaient âgés de vieux 36-47 mois, avaient vécu dans le quartier depuis plus de six mois, a rapporté aucune maladie systématique et signalé aucune prise d'antibiotiques pendant au moins un mois avant ont été inclus dans l'étude. Toutes les écoles participantes ont été informées et ont consenti à l'étude. Après le consentement écrit des parents a été obtenu, tous les enfants de 3 ans admissibles dans les écoles participantes ont été inclus dans l'étude.
développement Caries, hypoplasie de l'émail et de l'accumulation de plaque visible ont été déterminées par un seul dentiste (L.X. Yu). sondes IPC, des miroirs de la bouche jetables, et les sources de lumière intra-orales LED ont été utilisés pour les examens. L'état des caries dentaires a été enregistré selon les critères de l'Organisation mondiale de la santé à l'aide des indices de caod [18]. En bref, la présence de caries dentaires a été enregistrée quand il y avait une lésion évidente dans une fosse ou fissure ou sur la surface lisse d'une dent. Un mur ramolli détectable ou émail miné a également été enregistrés comme les caries dentaires. Hypoplasie de l'émail a été enregistré en utilisant les critères recommandés par la Fédération Dentaire Internationale (FDI) pour les enquêtes épidémiologiques générales [19]. Hypoplasie de l'émail inclus trois types de défauts: des fosses, des rainures ou d'émail manquant. L'hygiène buccale a été évaluée à l'aide de l'indice visible Plaque (VPI) [20]. Quatre sites d'distale, le plus proche du centre et mésial de surfaces buccales et le plus proche du centre de la surface linguale de chaque dent ont été examinés pour enregistrer le PIV. Le pourcentage des sites examinés avec la plaque visible a été calculée. Environ 10% des sujets ont été réexaminés pour évaluer la fiabilité intra-examinateur. Les échantillons groupés de la plaque dentaire de chaque enfant ont été recueillies avec des cotons-tiges stériles des surfaces vestibulaires des dents maxillaires. Les échantillons ont été dispersés dans un thioglycolate fluide stérile (FT) moyenne et pris au laboratoire sur de la glace dans les 4 h de la collecte.
Les données ont été recueillies à l'aide d'un questionnaire auto-administré qui a été administré aux aidants naturels. Le questionnaire comportait quatre parties: les caractéristiques socio-démographiques (par exemple, l'âge et le sexe des enfants, la profession et le niveau d'éducation des parents), les caractéristiques de développement (par exemple, l'âge gestationnel, le mode de livraison, le poids à la naissance et hypoplasie de l'émail), l'éducation générale l'histoire (par exemple, l'alimentation au biberon expérience et la durée de l'allaitement maternel) et le comportement de santé bucco-dentaire (par exemple, la consommation de sucre solide, la fréquence du brossage des dents et l'utilisation de dentifrice).
isolement de S. mutans
échantillons Plaque ont été mélangés et soumis à une sonication pendant 30 secondes et ont été dispersés pour obtenir une série de dilutions 10 -3 dilutions. Pour chaque échantillon, 50 ul de diluant ont été étalées sur des Mitis salivarius-bacitracine (MSB) l'agar, additionné de 20% de saccharose et 0,2 unités /ml de bacitracine et on les incube dans des conditions anaérobies (85% de N 2, 5% de CO 2 et 10% de H 2) à 37 ° C pendant 3 jours [21]. Nous avons choisi au hasard deux colonies de l'enfant, en fonction de la morphologie des colonies et les colonies testés pour leur capacité à fermenter le mannitol, le sorbitol, le raffinose, mélibiose, et l'esculine et de leur capacité à hydrolyser l'arginine [22]. Les souches bactériennes identifiées ont ensuite été repiquées sur agar MSB et conservés dans 50% de glycérol à -80 ° C avant utilisation.
Définition des groupes de cas et de contrôle
Pour explorer et de comparer les polymorphismes génétiques dans le gène de la srta de S. mutans
, les enfants ayant des caries distinctes expériences ont été prises en considération. Un total de 121 enfants sans carie avec S. mutans
ont été choisis au hasard comme le groupe sans carie, et 121 enfants avec caod ≥6 qui étaient S. mutans-
positifs ont été sélectionnés pour former le haut de la gravité caries groupe. Le score de caod du groupe de haute gravité était conforme à la catégorie utilisée dans une étude précédente [23].
Extraction de l'ADN chromosomique
souches de S. mutans ont été cultivées dans 2 ml de cerveau-coeur un bouillon d'infusion et on fait incuber à 37 ° C en anaérobiose pendant 18 heures. Les cellules centrifugées à partir des cultures BHI ont été mises en suspension dans 5% Chelex100, traitée avec 10 ul de 20 mg /ml de proteinase K à 37 ° C pendant 1 min, puis digérée à 56 ° C pendant 1 h, puis en faisant bouillir pendant 10 min. Les tubes ont été congelés sur de la glace pendant 3 minutes, et la suspension a été centrifugée à 12 000 tpm pendant 10 min. Le surnageant a été obtenu par PCR. La qualité et la quantité des échantillons d'ADN ont été mesurés avec un spectrophotomètre UV à 260 nm et 280 nm. Tout ADN a été stocké à -20 ° C avant une analyse plus poussée.
Amplification et séquençage du gène de la srta
Les amorces de PCR conçues par Primer ABI Designer V3.0 qui ont été utilisées pour amplifier le UA159 srta
gene sont répertoriés dans le tableau 1. Un fragment d'ADN 1035 pb portant le gène de l'srta a été amplifié à partir de souches de S. mutans. En raison de la limitation de la longueur du lit en séquence, nous avons amplifié et séquencé le gène en trois fragments qui contenaient des amorces de PCR 1 sections.Table se chevauchant utilisés pour la détection du gène de S. mutans srta
Amorce
séquence (5'-3 ')
taille du produit (pb)
Pair1-F
GACGTTTGGCAACTGGTGTG
557
Pair1-R
CCAAGCAATTAGGGCATTTC
Pair2-F
CAATGAAAAAAGAACGTCAATCTA
448
Pair2-R
TGTGAAGATCCGGTCATACCA
Pair3-F
CGGAATTGCCATTCCAGACT
721
Pair3-R
TCCGAAACTATCAAAGCAACAT
La réaction PCR a été effectuée dans un volume réactionnel de 25 ul. Les composants de la réaction PCR (conc. Finale) était 2,5 pi de tampon de PCR 10X, 0,2 mM de mélange de dNTP, 1,5 mM MgCl 2, 0,2 uM de chaque amorce, 100 à 400 ng d'ADN génomique en tant que matrice, et 2U de Platinum® Taq DNA Polymerase (Invitrogen, CA, USA). On a préchauffé la zone tempérée à 95 ° C 5 min. Le cycle de PCR était le suivant: dénaturation à 95 ° C pendant 30 s, annelage à 60 ° C pendant 30 s et allongement à 72 ° C pendant 50 s. Un total de 50 cycles ont été effectués, suivis par une étape d'élongation finale à 72 ° C pendant 5 min. Cinq microlitres de chacun des produits amplifiés ont été analysés par électrophorèse sur un gel d'agarose à 1,5%. Les produits de PCR ont été purifiés en utilisant un kit d'extraction de gel QIAquick (Qiagen, Hilden, Allemagne). En fin de compte, les produits ont été séquencés par la Life Technologies Biotechnology Company Shanghai (Life Technologies, Shanghai, Chine). logiciel Reporter Variant a été utilisé pour analyser les résultats de séquençage, et la séquence du srta de UA159 de S. mutans a été choisi comme une séquence de référence.
analyse statistique
analyse des données a été réalisée en utilisant le SPSS 16.0 logiciel. Les variables catégorielles et continues ont été comparées en utilisant un test du chi carré et un test indépendant échantillons t
, respectivement. Des analyses bivariées et logistiques multivariées ont été utilisées pour calculer les odds ratios (RUP) avec leur intervalle de confiance à 95% (IC) correspondant et d'identifier les facteurs associés à la carie haute gravité. le statut de Caries a été traité comme la variable dépendante (0 = caries de groupe libre, 1 = haute gravité des caries groupe). Les variables indépendantes étaient les facteurs qui ont pu influer sur le statut de la carie. Ces variables indépendantes avec P
& lt; 0,2, sur la base d'une analyse logistique bivariées, ont été testés en outre dans un modèle de régression logistique multiple. AP
valeur. & Lt; 0,05 pour tous les tests statistiques recto-verso a été considéré comme significatif: Résultats
L'analyse statistique des caractéristiques démographiques et socio-économiques des facteurs de développement sont présentés dans le tableau 2. Dans les indicateurs sociaux, nous avons trouvé de manière significative différentes distributions des âges (en mois) entre les groupes (P
& lt; 0,001). Parmi les variables représentant la santé bucco-dentaire comportement des enfants (tableau 3), la durée de l'allaitement maternel (P
= 0,09), la fréquence de la consommation de sucre solide (P
& lt; 0,01) et la proportion de VPI (P
& lt; 0,01) ont tous été significativement associée à la carie risk.Table analyse 2 bidimensionnelle des caractéristiques démographiques, socio-économiques et de développement par rapport à l'état des caries
Variables
contrôles (n = 121)
Cas (n = 121)
x 2
P-valeur *
COR (IC à 95%)
P-valeur
n (%)
n (%)
Part1 caractéristiques démographiques et socio-économiques
Sex
1.345
0,246
Hommes †
59
(48,8)
69
(57,0)
Femmes
62
(51,2)
52
(43,0)
0,72 (0,43 à 1,19)
0,198
scolarisation
Mère
1.369
0.242
≥12 ans †
74
(61,2)
65
(53,7)
& lt; 12 ans
47
(38,8)
56
(46,3)
0,74 (0,44 à 1,23)
0,242
du Père scolaire
3.615
0,057
≥12 ans †
87
(71,9)
73
(60,3)
& lt; 12
ans 34
(28,1)
48
(39,7)
0,59 (0,35 à 1,02 )
0,058
profession de la mère
1.813
0,404
0,413
Employer/Professional †
8
(6.6)
14
(11.6)
Employee/Non-professionnel
88
(72,7)
84
(69,4)
0.55(0.22-1.37)
0.196
Unemployed
25
(20.7)
23
(19.0)
0,53 (0,19 à 1,48)
0,224
occupation
Père
3.503
0,173
0,181
Employer/Professional †
22
(18,2)
29
(24,0)
Employee/Non-professionnel
92
(76,0)
90
(74,4)
0.74(0.40-1.39)
0.350
Unemployed
7
(5.8)
2
(1.7)
0,22 (0,04 à 1,15)
0,072
Mean (SD)
moyenne (SD)
t
test de
Age (mois)
41.6
(2.9)
43.4
(3.6)
−4.285
<0.001**
1.18(1.09-1.28)
<0.001
Âge de la mère à la naissance de l'enfant
27.1
(3.8)
26.4
(3.8)
1.517
0.131**
0.95(0.89-1.02)
0.132
Partie 2 caractéristiques de développement
âge gestationnel
0,066
0.797
≥37 semaines †
58
(47,9)
60
(49,6)
& lt; 37 semaines
63
(52,1 )
61
(50,4)
0,94 (0,57 à 1,55)
0,797
mode de livraison
0,281
0,596
Vaginal naissance †
73
(60,3)
77
(63,6)
césarienne naissance
48
(39,7)
44
(36,4)
0,87 (0,52 -1.46)
0,596
Poids à la naissance
2.381
0,123
≥2500 g †
118
(97,5)
113
(93,4)
& lt; 2500 g
3
(2.5)
8
(6.6)
2,79 (0,72 à 10,76)
0,138
hypoplasie de l'émail
-
-
Non †
121
(100,0 )
120
(99,2)
Oui
0
(0.0)
1
(0,8)
-
-
* test du chi carré, ** Test
échantillons indépendants t.
COR (rapport de cotes de brut), CI (intervalle de confiance), † Catégorie de référence.
Tableau 3 analyse bivariées de l'éducation générale et le comportement de santé bucco-dentaire par rapport à la carie statut de Variables
Controls (n = 121)
cas (n = 121)
x 2
P-valeur *
COR (IC à 95%)
P-valeur
n (%)
n (%)
Partie 1 éducation générale entre 0-3 ans
biberon expérience
0,764
0,382
Oui †
22
(18,2)
17
(14,0 )
Pas
99
(81,8)
104
(86,0)
1,36 (0,68 à 2,71)
0,383
Durée de l'allaitement
9,382
0,009
0,012
jamais allaité †
22
(18,2)
9
(7.4)
& lt; 1 année
84
(69,4)
84
(69,4)
2,44 (1,06 à 5,62)
0,035
≥1 an
15
(12,4)
28
(23.1)
4,56 (1,68 à 12,37)
0,003
Partie 2 comportement de santé bucco-dentaire à l'âge de 3
solide consommation de sucre
19,492
& lt; 0,001
& lt; 1 fois par jour †
86
(71,1)
52
(43,0)
≥1 fois par jour
35
(28,9)
69
(57,0)
3,26 (1,91 à 5,56)
& lt; 0,001
Fréquence de brossage des dents
0,154
0,695
≥1 fois par jour †
73
(60,3)
70
(57,9)
& lt; 1 fois par jour
48
(39,7 )
51
(42,1)
1,11 (0,66 à 1,85)
0,695
L'utilisation de dentifrice
0.000
1.000
1.000
toujours †
70
(57,9)
70
(57,9)
Parfois
29
(24,0)
29
(24,0)
1.00(0.54-1.84)
1.000
Never
22
(18.2)
22
(18.2)
1,00 (0,51 à 1,97)
1.000
moyenne (SD)
moyenne (SD)
t
essai
indice de plaque visible (%)
46.2
(20.9)
75.7
(15.8)
−12.386
<0.001**
1.08(1.06-1.10)
<0.001
* Test du chi carré, ** Test
échantillons indépendants t.
COR (rapport de cotes de brut), CI (intervalle de confiance), † Catégorie de référence.
En comparant les séquences de la srta du clinique souches avec UA159 de S. mutans, un total de 38 substitutions nucléotidiques simples ont été trouvés, dont 21 sites de mutation silencieuse et 17 sites de mutation faux-sens (figure 1). Le groupe sans carie a été constaté que 19 sites de mutation silencieuse et 11 sites de mutation faux-sens, alors que le groupe de la carie haute gravité a été constaté que 20 sites de mutation silencieuse et 14 sites de mutation faux-sens. Seulement dix souches étaient identiques à la souche UA159; de ceux-ci, cinq étaient dans le groupe sans carie, et cinq du groupe de caries haute gravité. Aucun des gènes du srta dans les séquences a une insertion de base ou de suppression. Figure 1 mutations ponctuelles dans les isolats cliniques. légende détaillée: L'isolat clinique n ° 306 (groupe libre caries) a des mutations ponctuelles à 78, 99, 112, 114, 165, 168, 176, 222, 249, 312, et 671 bases de locus. Le n ° 139 isolat clinique (groupe caries haute gravité) avait une mutation ponctuelle à 78, 150, 165, 168, 176, 671 bases de locus. Sites de mutation Silent dans les souches cliniques ont été identifiés à des positions 48, 78, 85, 99, 138, 150, 162, 165, 183, 186, 222, 237, 249, 261, 312, 357, 582, 615, 636, 669 et 717.
sites de mutation faux-sens dans les souches cliniques étaient identifié au niveau des positions 23, 34, 36, 47, 100, 112, 114, 168, 176, 256, 298, 382, 470, 548, 584, 671 et 706. Les transversions d'acides aminés en raison de mutations faux-sens sont présentés dans le Tableau 4. ici, nous montrons que les altérations des acides aminés en raison de mutations faux-sens parce que ces changements pourraient affecter l'activité des sortase A.Table 4 Transversion d'acides aminés due à des mutations faux-sens selon codons
base de sites
UA159
souches clinale
Codon
acide aminé
Codon
acides aminés
23
AGG
Arginine
AAG
Lysine
34
AGT
Serine
GGC/GGT
Glycine
36
AGT
Serine
GGC/GGT
Glycine
47
ACC
Threonine
ATC
Isoleucine
100
CCA
Proline
TCA
Serine
112
GCC
Alanine
ACC/ACT
Threonine
114
GCC
Alanine
ACT
Threonine
168
GAT
Asparaginic acide
GAG
glutamique acid
176
CAC
Histidine
CGC
Arginine
256
GCT
Alanine
TCT
Serine
298
GAC
Asparaginic acid
AAC
Asparagine
382
GTC
Valine
ATC
Isoleucine
470
CGT
Arginine
CAT
Histidine
548
GTC
Valine
GCC
Alanine
584
CCG
Proline
CTG
Leucine
671
AAT
Asparagine
ACT
Threonine
706
GCT
Alanine
ACT
Threonine
Les fréquences de distribution des sites de mutation faux-sens sont indiqués dans le tableau 5. Il y avait une différence significative dans la fréquence des mutations au locus 168 (P = 0,023
); la fréquence des mutations dans ce site était significativement plus élevé dans le groupe exempts de caries que dans le groupe de carie de sévérité élevée. En outre, les souches avec le locus 470 polymorphisme présentait un taux significativement plus élevé dans le groupe des caries haute gravité par rapport au groupe sans carie (P
= 0,032) .Table 5 analyse de bivariées du missense taux de mutation par rapport à l'état des caries
mutation faux-sens
contrôles (n = 121)
cas (n = 121)
x 2
P-valeur *
COR (IC à 95%)
P-valeur
n (%)
n (%)
23 G → A †
5
(4.1)
12
(9.9)
3.100
0.078
2.55(0.87-7.49)
0.087
34 A → G
7
(5.8)
10
(8.3)
0.569
0.450
0.68(0.25-1.85)
0.453
36 T → C
6
(5.0)
11
(9.1)
1.582
0.209
1.92(0.69-5.36)
0.215
47 C → T
8
(6.6)
11
(9.1)
0.514
0.473
1.41(0.55-3.64)
0.475
100 C → T
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
112 G → A
71
(58.7)
71
(58.7)
0.000
1.000
1.00(0.60-1.67)
1.000
114 C → T
65
(53.7)
56
(46.3)
1.339
0.247
0.74(0.45-1.23)
0.248
168 T → G
26
(21.5)
13
(10.7)
5.166
0.023
0.44(0.21-0.90)
0.025
176 A → G
63
(52.1)
68
(56.2)
0.416
0.519
1.18(0.71-1.96)
0.519
256 G → T
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
298 G → A
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
382 G → A
1
(0.8)
0
(0.0)
—
1.000**
—
1.000
470 G → A
7
(5.8)
17
(14.0)
4.625
0.032
2.66(1.06-6.68)
0.037
548 T → C
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
584 C → T
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
671 A → C
115
(95.0)
116
(95.9)
0.095
0.758
0.83(0.25-2.78)
0.758
706 G → A
0
(0.0)
1
(0.8)
—
1.000**
—
1.000
* Test du chi carré. ** Test exact de Fisher.
† G → A, G représente la base de 23 locus UA159, A représente la base de 23 locus dans les souches cliniques.
COR (rapport de cotes de brut), CI (Intervalle de confiance).
pour contrôler les facteurs de confusion, de multiples analyses de régression logistique ont été réalisées, et les résultats (tableau 6) ont montré que plus l'âge (P = 0,027
), les fréquences élevées de la consommation de sucre solide (P
& lt; 0,001 ), l'allaitement prolongé (P = 0,028
), une forte proportion de la plaque visible (P
& lt; 0,001), et les souches de S. mutans avec un T au lieu 168 du gène de la srta (P = 0,023
) étaient significativement associés à la carie haute gravité chez les enfants. Un risque plus faible de caries haute gravité (AOR = 0,32, IC à 95% = 0,12 à 0,86) a été trouvée chez les enfants qui portaient les souches de S. mutans avec un G au locus 168 du gène de la srta par rapport à T. Cependant, après contrôle des facteurs de confusion, la mutation au locus 470 a été exclu du model.Table 6 Résumé des variables de plusieurs résultats de régression logistique les
B ‡
sE
P
AOR
IC à 95% pour AOR
Lower
Upper
Les mutations au locus 168
Non †
Yes
−1.156
0.510
0.023
0.32
0.12
0.86
Duration de l'allaitement
0,028
Jamais allaité †
& lt; 1 année
1.273
0,651
0,050
3,57
1.00
12,79
≥1 an
2.058
0,772
0,008
7,83
1,73
35,54
consommation de sucre solide
< (months)
0.131
0.059
0.027
1.14
1.02
1.28
Visible (%)
0.090
0.012
<0.001
1.09
1.07
1.12
Constant
−16.110
3.263
<0.001
0.00
